醫療污水處理工藝選擇的原則： a、傳染病醫院必須采用二級處理，并需進行預消毒處理。
b、處理出水排入自然水體的縣及縣以上醫院必須采用二級處理。
c、處理出水排入城市下水道的綜合醫院推薦采用二級處理，對采用一級處理工藝的必須加強處理效果。
d、對于經濟不發達地區的小型綜合醫院，條件不具備時可采用簡易生化處理作為過渡處理措施，之后逐步實現二級處理或加強處理效果的一級處理。
醫療污水處理的步驟：
（1）醫院生活污水進化糞池，經化糞池處理后進格柵池，經格柵去除大懸浮物后進入調節池，柵余物轉至站內醫療廢物垃圾池；
（2）污水經格柵池后進入調節池，調節池污水通過提升泵送至水解酸化池，通過水解酸化作用，將大分子物質分解為小分子，提高污水生化效果，減輕接觸氧化池處理負荷；
（3）污水經水解酸化池后進接觸氧化池，通過附著在填料上的生物的吸附、氧化等作用，將污水中的有機污染物逐步氧化成二氧化氯、水或合成細胞物質，使污水得到凈化，設置于水解酸化池與接觸氧化池之間的混合液回流泵，將接觸氧化池污水回流至水解酸化池，實現脫氮目的；
（4）接觸氧化池出水加絮凝劑反應生產礬花后進沉淀池，進行泥水分離，沉淀池出水入消毒池，消毒池中通入二氧化氯并通過混勻器混勻，進行消毒處理以后，較后通過脫氯作用后排放；
（5）沉淀池中的進行泥水分離以后，污泥通過污泥泵輸送至污泥濃縮池再沉淀以后，上清返回水解酸化池再次循環處理；污泥經脫水、干化以后進行填埋處理。
